No non lo risolve, risolve solo la questione supporto ai nuovi modelli di micro, come il 4313, non inseriti nella versione precedente.
Non esiste una release di WinAvr con il compilatore superiore alla 4.3.3, è un progetto fermo dal 2010, non so se usciranno nuove release e poi si basa sulla versione originale di avr-gcc, quella che sta facendo dannare gli altri con Linux, quindi è meglio che rimane così 
Spezzo io una lancia a favore dell'Arduino Team, probabilmente sanno benissimo quali sono i problemi delle varie release di avr-gcc, e forse è proprio per questo motivo che sono rimasti con la 4.3.2 che almeno funziona senza particolari intoppi con Arduino ad esclusione della questione MEGA2560.