En la pantalla FT843 (FT800) de 4D systems, el propio gameduino 2 y en la FT801 de Riverdi, no he usado las lineas INT ni PD.
Como indicas es posible que el FT800 en tu pantalla, esté conectado de forma muy austera.
Esperemos que tengas funcionando correctamente tu pantalla en el arduino Due. Gracias por compartir los avances.