Hola Mikel, saludos desde Colombia.
Arranco diciéndote pues que no tengo experiencia en cuanto al sistema eléctrico del coche, entonces no se que características tenga el cable de bobina que mencionas, pero por lo que veo del post que pusiste básicamente es un punto, que te permite obtener una señal eléctrica oscilante entre 0 y 12v o poco mas.
Comenzando con los problemas que mencionas y basándome en el circuito que plantean en el post que pusiste, pues con respecto al primer punto de miedo a achicharrar el arduino pues con ese circuito no hay de que preocuparse en caso de fallo a lo sumo se dañaria el 4n25, pero eso en caso de que el voltaje de entrada de la bobina se elevara demasiado, osea que por el arduino no te preocupes.
Con respecto a los componentes no entiendo porque dices que no los sabes si en dicho post te dan el listado.
Ahora ese circuito que posteas lo veo funcional ¿ya lo probaste?.
Por acá estaré si te puedo servir en algo mas.