Ciao! Premettiamo che stai usando una libreria, il display si potrebbe controllare anche senza librerie ma sarebbe molto complicato!
Nel link che hai mostrato c'è la soluzione, forse non è cosi immediato capirla per un principiante come NOI! 
Nel display a 7 segmenti gestisci la stampa su un solo riquadro! Se il display è a 2 cifre, prima stampo le unità e poi stampo le decine, non è come un lcd che automaticamente stampa più cifre.
Per cui tu hai un numero intero che va da 0 a 90,
- Ti ricavi le unità
2)Ti ricavi le decine - Stampi le unità sul display
- Stampi le decine sul display
Adesso per ricavare le unità prendi il resto della divisione per dieci, e in C si fa con l'operatore %
Esempio :
int contatore=46;
int unità=0;
int decine=0;
void loop(){
unita=contatore%10; // Il resto della divisione per 10 sono la cifra unità
decine=contatore/10; // Divido il numero per 10 e ottengo le decine
lc.setDigit(0,0,(byte)unita,false);// stampo le cifre delle unita
lc.setDigit(0,1,(byte)decine,false);// stampo le cifre delle decine
}