Si claro que puedes. Siempre que el consumo supere 350 mA considera una alimentación externa.
Lo único que debes hacer es lo siguiente. Todo lo que es control queda como esta, o sea las conexiones que salen del Arduino y van a los servos incluido GND.
Luego debes alimentar tus servos y para ello usarás otra fuente de la potencia adecuada y solo compartirás GND con el Arduino.
Respecto del simulador no lo conozco pero te aconsejo que aproveches la comunidad compartiendo tu objetivo de la forma mas detallada posible y el codigo. Se que te has explicado pero yo sigo sin comprender totalmente la idea.
Entonces el mismo código que usas en el simulador lo posteas aca (con etiquetas) y nos dices que pretenden y vamos avanzando con el mejor grupo de simuladores que tiene el foro Arduino.
Que te parece la idea?