Ho una ubuntu 10.04, kernel pae.e non mi stacco neanche morto da gnome 2. quindi ho un ambiente standard su cui testare, mi manca il tempo per adesso, ma tra un pò mi metterò a testare volentieri.
Io se legacy è disposto a condividere farei quello che ha fatto lui, cioè in pratica si applicano le path si compila e si installa su file system ext, poi questo file si monta in loop device e da shell si avvia arduino, così L'ide vede un /usr/avr e /usr/bin che sono quelli presenti nel file montato.
Purtroppo neanche tu hai hardware per fare il test, perchè anche la mega con il 1280 ha solo 128K, ma che fine hanno fatto quelli che hanno la Mega?
Ciao.