Sin entrar en debate si PIC o Atmel, ya que como todo en esta vida, pues cada uno tiene ventajas e inconvenientes. Practicamente ambos fabricantes tienen modelos semejantes en cuanto a prestaciones. Lo que si es cierto, que la ventaja de Arduino es la cantidad de librerias, codigo, ejemplos, etc que puedes encontrar que te ayudara muchisimo para empezar. Ya que la filosofia open hardware por detras del proyecto, hace posible tener un monton de recursos.
Siempre se abren debates que si PIC VS Atmel, que si PLC Vs Microcontroladores, etc... al final, lo mejor es usar lo que mas convenga para cada aplicacion.
Para controlar un display alfanumerico, ambos lo hacen igual de bien.... 
Si no tienes mucha experiencia en ninguno de los dos como para decantarte por uno, pues seguramente Arduino sea la mejor eleccion... pero al final, la eleccion se deberia hacer justo opuestamente, primero necesitarias analizar que requerimientos vas a necesitar, y luego elegir la tecnologia que mejor se ajuste para resolver el problema.
Por lo que has contado, tienes bastante HW de por medio para adaptacion de las senyales.
Por curiosidad, que motor usa un bicho de esos?
Saludos y animo con el proyecto que suena interesante.
Igor
Nota.- ni acentos ni enyes.