La chipKit32 è da un anno che è in circolazione, non è spuntata ora 
Comunque la domanda è: che devi farci?
La DUE è sicuramente più potente della MEGA ma lavora a 3,3V per cui devi stare attento perché diversi shield per l'Arduino UNO e MEGA con la DUE non potrai usarli. La MEGA è fondamentalmente simile alla UNO: hai però più I/O e più memoria, ma la programmi e gestisci pressappoco come la sorella minore.