Il reset lo colleghi solo se serve, altrimenti lo lasci libero.
Su Aref c'è un condensatore da 100 nf, se non usi una specifica tensione esterna lo lasci scollegato e usi come riferimento il 5V di alimentazione, di default nel IDE di Arduino, oppure una delle due tensioni di riferimento interne previste sul Atmega2560, 2.56 V e 1.1 V, da settare con l'apposito comando nello sketch.
Una nota sull'alimentazione, la tensione può essere compresa tra 4.5 e 5.5 Volt come range ammesso, da specifiche del Mega2560.
Volendo è possibile alimentare la scheda a 3.3 V però in questo caso vanno modificati i fuse per usare l'oscillatore RC interno a 8 MHz in quanto con questa tensione non è possibile il funzionamento a 16 MHz, in alternativa è possibile cambiare il quarzo con uno da 8 MHz, in questo caso non è necessario modificare i fuse.
Nota tecnica, il quarzo montato sulla scheda non è di quelli in case smd microscopico, ho optato per un quarzo in case HC49 ribassato con montaggio smd, sono facili da dissaldare/risaldare, in modo da rendere "facile" la loro sostituzione.
Quarzo: