Castillo me parece muy interesante tu proyecto, tengo que repasar detenidamente el planteamiento, porque no termino de entender las ventajas de trabajar con la opción Automático/Manual tal y como se emplea en la industria, en la domótica por no existir peligro alguno para el usuario se suele trabajar en un modo combinado sin hacer distinciones. A primera vista, el esquema que publicaste del conmutador necesitabas tres relés cuando con un solo relé biestable es suficiente con lo que reducirá el coste de las placas algo indispensable si quieres que tu sistema desbanque a otros ya consolidados y de reconocidas marcas.
Yo por ahora estoy intentado aprender al máximo sobre Arduino porque necesito desarrollar un sistema de control remoto muy economico, así que de momento estoy en la "escuela", pero si necesitas mi ayuda estaré encantado de ayudarte, llevo 10 años haciendo instalaciones con KNX y alguna que otra automatización industrial.
Suerte campeón!!!