come su un'altra finestra? 
e che c'entra l'UNO? Temo che ci sia un po' troppa confusione.
Le istruzioni sono quelle del mio post, una volta che Arduino ISP l'hai caricato sull'UNO (mediante il normale UPLOAD) trasformi questa board in un Programmatore, lo sketch lo devi chiudere, poi cambi board nell'IDE, selezionando quindi l'oggetto da programmare (la tua MEGA), e da quel punto in poi Arduino UNO sa che se gli mandi uno sketch mediante il comando "carica con un programmatore" lo deve trasferire via ISP alla board MEGA, quindi niente cambi al volo, niente doppie finestre, niente di niente, SOLO le istruzioni scritte, non c'è niente da dedurre, solo da seguire alla lettera