LED SEQUENZA NEOPIXEL

Come dice @fabpolli, dovresti rivedere tutto il programma (cicli for), aggiungo anche per quanto riguarda l'uso del telecomando, cosi com'è avrai dei problemi. Ti consiglio la lettura di questo articolo.

In merito alla luminosità, dovresti evitare di aggiornare la strip (pixels.show()) ogni volta che la modifichi.
Se, come credo, vuoi modificarla mentre la sequenza è in corso, allora metti in una variabile quella nuova, un'altra quella vecchia. Prima di ricominciare la sequenza, le confronti, e se sono diverse, allora cambi la luminosità (pixels.setBrightness(nuova)).
In questo modo ti risparmi l'aggiornamento di tutti i pixel per la sola luminosità, che non è poco!

Federico