Ein Quarz kann eigentlich nicht heiß werden; er ist mehr oder weniger ein Kondensator dessen Besonderheit eine mechanische Formänderung bzw Kapazitätsänderung mit der Spannung ist, die bei der Resonanzfrequenz am größten ist. Da ist nichts das heizen könnte.
Wenn der Quarz kaputt ist, dann funktioniert auch der ATmega16u2 nicht und darum die USB-Verbindung bzw Boarderkennung am PCs.
Auch ich tappe im dunkeln.
Grüße Uwe