C'è il discorso https, qui la cifratura è inyegrata in HW.
Poi il bluetooth, Sia Classic che Ble
Poi c'è il coprocessore, che può fare gestione di sensori tenendo spente le due Cpu.
Il problema è il core Arduino, che pur essendo Ufficiale è indietro anni luce.
Ad esempio il dns server è stato integrato da pochissimo solo grazie ai tipi di wifimanager coi quali ho collaborato rompendo le palle con issue e test 
Mentre il Webserver non c'è ancora, sei costretto ad usare webserver modificati da terzi.
Nemmeno il board manager è presente, purtroppo sembra che aver deciso di creare ufficialmente un core arduino invece di velocizzare le cose le rallenta