in liena di massima non è complesso quello che vuoi fare, colleghi la fotoresistenza (meglio un fotodiodo in quanto più veloce a commutare) tra un pin di arduino e massa, e sempre tra lo stesso pin e il positivo ci colleghi un trimmer/potenziometro così da regolare il punto di soglia che vuoi commutare. Dal lato arduino si tratta di usare l'impulso per far partitre un cronometro (millis()) conteggiare il passaggio di tot bottiglie e poi rileggere il cronometro per fare il calcolo del tempo passato e visualizzarlo dove preferisci.... Visto il passaggio veloce delle bottiglie è meglio se utilizzi un interrupt per gestire il conteggio.