Justo cuando has contestado, estaba editando con otro punto mi post.
La placa con micro, no la tienes conectada al PC y abriendo el puerto mientras las pruebas, verdad??
Me refiero, sólo tienes abierto en el PC, el puerto serie correspondiente a la placa SIN micro.
La otra placa CON micro,NO tiene la conexión serie abierta con el PC. Es más, si estás sacando la alimentacion directamente de la otra placa, no tienes ni el usb conectado a dicha placa.
??