Buenas JollyRoyer, sí se puede hacer eso que pides, de varias maneras de hecho. Se me ocurre que podrías usar una Leonardo para emular pulsaciones de teclas (esto en principio valdría para cualquier simulador). Sí el simulador acepta plugins: un plugin en el juego escuchando a una Uno por ejemplo y que sea el plugin el que ejecuta las órdenes que le manda la Uno. Sin saber que Arduino tienes ni de que simulador hablas no se me ocurre nada más... 
Salud.
PD: te dejo enlace a proyecto similar para un simulador de vuelos espaciales al que juego regularmente, este es via plugin: http://forum.kerbalspaceprogram.com/threads/66393