leo72:
Scusa, non ho capito questa affermazione. Nella 1.0.1RC vedo che la toolchain è stata inserita anche nella versione per Linux, e vedo anche che il compilatore la usa al posto di quella presente sul sistema.
Quello che ti sfugge è che la toolchain è sempre quella di gnu.org, non è quella di Atmel.
Con la versione per Linux della 1.0.1 RC1 non c'è allegata nessun compilatore, devi sempre installarlo partendo dal repository, la differenza è che viene posto all'interno della cartella del IDE e viene usato questo al posto di quello di default eventualmente installato nel sistema, però questa cosa dovrebbe rendere molto più semplice la sostituzione con la toolchain Atmel.