Io ho per esempio la cartella Ardutester con dentro le varie versioni v06d, v06e, etc.
In Arduino->Sketchbook mi visualizza Ardutester con sotto le varie versioni (cartelle). In effetti sarebbe bello fosse visualizzato come in Arduino->Examples
Adesso vedo se trovo uno schema Arduino like (Anche se io preferisco alla lunga il Monokai di default)
Certo che gestisce le TAB. Fai una prova, trascina la cartella di un tuo progetto all'interno di Sublime...
Altra cosa che mi piace è la Minimap sulla destra (Comodissima per listati lunghi), Il Serial Monitor, la possibilità di gestire i flag del compilatore e tantissime altre features. E poi legge qualsiasi tipo di file!
edit
Project->Open Project e apri il tuo lavoro
Arduino->Show Sketch Folder e trovi tutto ordinato 
riedit
Installa anche questo:
http://wbond.net/sublime_packages/package_control
Serve per gestire i vari pacchetti di Sublime