Non credo sia possibile ma credo che non sia necessario.
Se ad esempio abbiamo connessione, una comunicazione via software, all'avvio del software possiamo trasmettere un carattere di comando, che ricevuto da arduino fa si che si avvii una funzione di trasmissione dati.
Se invece vogliamo che la comunicazioni inizi dopo un collegamento hardware "collegamento di un cavo", possiamo in vari modi agire su un pin arduino, e in base al valore del pin iniziare la trasmissione sulla seriale.
Per cui sia per una connessione software, sia per una connessione hardware, ci sono soluzioni alternative.