fabpolli:
Quindi alimenterei la scheda da EXT5V e relativo GND e quando mi serve riprogrammare connetterei loo strip a 4 pin e tutto dovrebbe funzionare, giusto?
Dal connettore per la programmazione tramite bootloader, UART 0, puoi anche alimentare la scheda, se è già alimentata in altro modo basta che colleghi solo GND, Tx, Rx e DTR.
USB5V e EXT5V in realtà sono in parallelo, è la stessa pista riportata su due punti diversi.