Was für Komponenten kommen noch an den Arduino? Vorallem mit welchen Spannungen arbeiten diese?
Ich würde bei einer Gesamtlast < 500mA einfach den USB Port mit einem normalen USB Netzteil versorgen. Wenn die Last > 500mA oder eine andere Spannung benötigt wird, mit einem StepDown Regler für 5V den Mega an den Pins speisen.
Den PowerJack finde ich am Arduino sowieso nicht sonderlich sinnvoll. In meinen Augen lediglich für Batterien zu gebrauchen. Speise meine Leds auch mit einem 5V 2A Netzteil, welche direkt einen Abzweig zum Shield bekommen, der dann den Uno speist. Falls die 5V nicht konstant gehalten wird, dicken Kondensator parallel schalten, oder einen StepDown/Up Regler für den Uno. Am Power Jack Anschluss wird über 7V die restliche Spannung am Linearregler verbraten.