Quale sistema?

Monumenta:
Cioè io apro il monitor seriale (ma non sono sicuro che sia il serial terminal) e provo a digitare

Per queste cose non puoi usare il monitor seriale, usa Putty/Kitty, o equivalente, tramite SSH oppure seriale, nel secondo caso prima carica sulla Yun lo sketch "esempi->bridge->YunSerialTerminal" che redireziona la UART hardware, collegata al lato Linux, verso la USB.