Nehm keine SMD Pads für die Befstigung von Kabeln. Besser ist es Pinleisten mit Offset zu nehmen (längere Kupferfläche an einer Seite). Abblockkondensatoren näher an die VCC/GND Pins. In der Mitte links über den Atmega hat der Kondensator keine Verbindung.
GND sollte sichtbar als Leitung verlegt werden, auch wenn man CopperFill nutzt.