OK surbyte, acepto la prueba. He descargado sublime text 2 portable. Ya he configurado sublime text 2 con stino, y comparado con el IDE 1.6.1, sí que compila más rápido sublime text. En el ejemplo de blink with delay hay una diferencia de 4 segundos.
Me pasa una cosa muy curiosa. He hecho la prueba con 2 pc's. Cuando pruebo con un Core 2 Quad, al compilar el ejemplo del BlinkWithoutDelay, en Sublime Text tarda unos 14 segundos y en IDE unos 18, en cambio, cuando lo pruebo en un Intel i5, es al revés, con Sublime Text tarda unos 8 segundos y con el IDE unos 7.
De todas formas, no acabo de entender las diferencias de velocidad, ya que Sublime Text, usa el directorio del IDE para trabajar, de forma que entiendo que usan el mismo archivo AVR para compilar.