Bueno, pues solucionado! En el UNO R3 unir GND con Reset y anulado el Atmega 328 del UNO, dejando sólo el 16U2 que es el encargado de la conersión USB-TTL funciona (He leído que con hay que unirlo con un condensador de 10uF, yo con un cable de 5cm no he tenido problema). Con el Leonardo no se puede ya que como comentó un compañero, el FTDI está integrado dentro del MCU principal. Y ahora estoy probando con un Mega 2560, que es clónico y no usa un 16U2 , seguiré informando... Que cuantos menos "cacharros" se usen mejor 