duda conexion

este es el primer ejemplo que uno realiza el famoso blink, mi duda es la siguiente, si yo quisiera alimentar el led con una fuente externa ej. bateria 3 volt, como seria el conexionado, ya que el negativo de la bat con el negativo del arduino y de ahi a led es correcto? mi duda es el positivo de la bateria, como quedaria??

En tu esquema no usas 5V. Usas el pin para entregarle el HIGH de modo que no es posible lo que quieres a menos que cambies el enfoque.
En lugar de tu esquema que tal este

El rojo esta a 5V del arduino y al protoboard. Pasa por la R de 1kohm al anodo del LED y del cátodo va al pin 13. En la figura se ve que el cátodo va a GND. No encontré otra.
Algo asi

entonces el led funcionará cuando envies un LOW con este comando digitalWrite(13, LOW);
y no como antes que enviabas un HIGH.

Si en este esquema nuevo tu usas una fuente externa de 3V, entonces si va a funcionar en tanto y en cuanto compartas tambien GND de arduino con GND de la fuente de 3V.

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