le isp efface completement le chip avant flashage ?
Tout dépend de ce qu'il y a dans la ligne de commande d'avrdude.
L'effaçage avant reprogrammation n'est pas obligatoire, c'est une option à configurer.
Si on lit la doc d'avrdude et qu'on fait le transfert à main du fichier *.hex on maitrise ce que l'on fait, si on le fait au travers de l'IDE c'est l'IDE qui décide.
Il doit bien y avoir un moyen de reconfigurer l'IDE mais vu le temps de recherche autant lire la doc d'avrdude.