MISO, MOSI e CLK sono pin fissi, a seconda del chip che usi.
Il pin SS è a scelta, su Arduino Uno di solito i tre fissi sono 13,12 e 11 e quindi viene naturale usare come SS il 10, ma non è obbligatorio usare quello.
"It is, however, possible to use any pin as the Slave Select (SS) for the devices. "
In stand-alone sul AtMega328 quali pin usi? PB5->SCK PB4->MISO PB3->MOSI PB2->pin 10 arduino uno (SS)
Cosa intendi per programma base? Quel modulo non ha una libreria standard nell'IDE. Devi scaricare una libreria di terzi.
Quale usi ?