tienes que fijarte en el regulador que lleva ,si es como el del dibujo de tu enlace y tiene un AMS1117 ,quiere decir que acepta hasta 12v por el pin vin (positivo) y el pin gnd (negativo).Cuando alimentas por vin ,pasas por dicho regulador y hay una pequeña perdida de voltaje ,por lo que en realidad estas suministrando menos de esos 3.3v .prueba a alimentar por vin como minimo con 5v.repito ,asegurate que tu placa tiene este regulador.