Tu peux l'utiliser oui.
Tu peux t'attendre, quelque soit le mode d'alimentation, que si tu fait de l'extraordinaire (comme vouloir rouler à 120km/h en descente avec une 2 CV), ça risque de chauffer.
Mais si tu fais de l'ordinaire, tu peux, comme le stipule Arduino, alimenter en 12V (et ne pas rouler à fond dans les descentes).
Le tout est de définir ce qui est raisonnable ou pas.
Et sache que le régulateur 5V sur ta carte Arduino est "auto protegé" des surchauffes, donc ne craint pas qu'il t'explose à la figure, fais et réflechis à ce que tu fais pour éviter de charger inutilement le 5V.