Senza dimenticare che 12V sono già tanti come drop-out, e quando l'alternatore "carica" arriva anche a 14-15V, la batteria deve essere ricaricata. Poi molto dipende da quanto consumerà Arduino ed i suoi componenti extra. Io mi collegherei a valle dl regolatore stabilizzatore 12V e non sulla batteria e, se del caso, adotterei uno stabilizzatore 5V 1A esterno, ben alettato e adeguatamente raffreddato, da collegare a Vin, in modo da escludere il regolatore interno di Arduino.