bada, questa è la mia idea, Uwe diceva altro, altri diranno altro; io realizzerei un circuitino stabilizzatore a 5V, giusto 4 condensatori ed un regolatore 7805, una bella impedenza antidisturbo in ingresso, e prleverei i 12V dal regolatore della moto, così almeno hai 12V fissi e non variazioni fino a 14-15V, come sulla batteria. Naturalmente il 7805 va adeguadamente raffreddato e ventilato, i 5V in uscita li colleghi al pin Vin di Arduino, i GND in comune; in tal modo eviti il surriscaldamento brutale del 7805 interno di Arduino.
Metti subito in conto la sostituzione della/e pipetta/e della/e candela/e con il modello antidisturbo, altrimenti non ci sarà impedenza che tenga.