Dat blauwe cap verhaal kun je vergeten. Is een filter naar GND zie ik nu. Ik ben nu eenmaal een schema lezer 
Dat je toch wat meet op de analoge poort als er geen signaal op staat komt vermoedelijk omdat je de ingang niet naar GND trek. Daardoor pakt de ingang ruis en 50Hz brom op. enkele uVolt is al voldoende door de versterking.
Wat ik mis overigens is de negatieve feedback in de opamp schakeling.
Een opAmp kan gerust 100.000 x versterken. Dus als er slechts 1mV op staat zou het al theoretisch versterkt worden naar 100V. Dat kan dan wel niet omdat de voeding slechts 5V is.
Je moet dus de opamp instellen dat het signaal pp (point-2-point) maximaal 5V is. Anders gaat het signaal afkappen op de 5V en 0V.
Het signaal wordt tevens verzwakt door de weerstands deler via 2 stromen:
a) via de elco en de weerstandsdeler (naar GND) maar ook parallel daaraan via de weerstandsdeler via de VCC alsnog naar GND.
Het is mij ook niet duidelijk wat de geluidsbron is?