Ich habe noch keinen Scatch. Ich wollte einfach erstmal nur probieren, ob das über Ethernet grundsätzlich funktioniert. Dafür habe ich die o.g. Anleitung befolgt und folgenden Matlab-Befehl genutzt:
arduinomega2560_tcpsend
und anschließend den "deploy to hardware" button gedrückt. Dann kam besagte Fehlermeldung 
Ehrlich gesagt weiß ich auch nicht genau was der Sinn dieser Anleitung bzw. zu welchem Ziel sie führen soll. Ich stehe gerade noch am Anfang der Einarbeitung
Ich nutze eigentlich auch einen Controllino Mega 2560. Über USB konnte ich mit Simulink zumindest einzelne Ports erfolgreich ansteuern...