Herzliches Beileid, dein virtueller Mikrocontroller ist an einer Überdosis Spannung verstorben. 
Im Grunde schaltest du die LEDs mit dem Transistor richtig, allerdings gibst du die Versorgungsspannung direkt auf den 5V-Pin des Arduino. Das wird er dir garantiert nicht verzeihen. Die einfachste Lösung wäre es, die Leitung auf Vin zu legen, denn dahinter sitzt ja der Spannungsregler, der für die 5V-Versorgungsspannung des Mikrocontrollers sorgt.