Se sono degli switch praticamente usi i pin analogici come digitali, che c'entra l'ARef? Infatti nello schema che hai linkato non è usato. LS1 e LS2 in base allo stato del rispettivo switch, mantengono i pin A2 e A3 (e non A3 e A4) o sul LOW (pull-down 1K) oppure su HIGH. Nello sketch ti basta usarli come comuni pin digitali (16 e 17) e leggerne lo stato. L'ADC puoi proprio evitare di alimentarlo e l'ARef lo lasci in pace, non ti servono a niente