No he trabajado con esa placa pero creo que tienes que configurar el DIP para que el atMega328p se comunique con el esp8266.
Del foro he obtenido esto:
ATmega <-> ESP8266 1100000
USB <-> ATmega 0011000
USB <-> ESP8266 0000111 (Update firmware or sketch)
USB <-> ESP8266 0000110
All independent 0000000
Lo puedes ver en este enlace
El USB es compartido. En la posicion USB<->Atmega programas el atMega. En la posición USB<->ESP8266 puede subir sketch al esp8266. El interesante es el modo ATMega<->ESP8266. Aquí se supone que el puerto serie de ambos chips se conecta entre ellos y tienes que realizar una comunicación. El atmega debe decirle el valor de los pines digitales/analogicos via serie y el ESP debe leerlos y transmitirlos a la red o trabajar con ellos.