oldchap:
Mais si tu peux me donner la chaîne avrdude en utilisant le bootloader arduino pour avrstudio je suis preneur
Il suffit de regarder la console lors de l'upload, tu as toi même posté la solution à ta question 
avrdude -C chemin\vers\avrdude.conf -p atmega2560 -c stk500v2 -P \\.\COM6 -b 115200 -D -U flash:w:ton\fichier\compiler.hex:i