Arduino Quemado

Me estaba dedicando a hacer una practica en mi arduino Mega 2560 y al parecer conecte mal el voltaje de salida hacia unos motores que hasta mi computadora quemo gran parte de ella, mi duda es: al conectar al arduino sigue encendiendo bien pero solo toco los pines de la entrada pwm y el foco que enciende a la hora de conectarse el arduino a la corriente comienza a atenuarse o inclusive apagarse, saben si hay alguna solución para ello?

No te termino de entender.
AL MEGA le puedes cargar un programa nuevo?