Il problema non dovrebbe dipendere dall'IDE utilizzato però se scarichi l'ultimo, il 1.0.5-r2 è meglio
--> http://arduino.cc/en/Main/Software
Puoi scrivere qui il tuo sketch? (per vedere come fare guarda il punto 7 del regolamento --> [REGOLAMENTO] Come usare questa sezione del forum - Italiano - Arduino Forum)