Misura la resistenza tra il pin Vin e il pin 5V. Se é bassa vuol dire che tutto l'arduino ha ricevuto 12V percui rotto tutto ATmega328 compreso. Non avrei altra spiegazione per i sintomi da te spiegati.
Non tentare di sostituire i perzzi. Se non hai esperienza di saldare SMD e la relativa attrezzatura non ci riesci.
Ciao Uwe