Atmega328 a 9V

[leo72]

devi verificare che non sia attivo il brown-out detection, magari è quello che ti sta impedendo di alimentarlo a tensione bassa.

Quoto. Sei hai preso un chip che aveva in precedenza il bootloader dell'Arduino, quel chip ha il brown-out preimpostato a 4,7V. Devi quindi modificare anche quel fuse lì.