Sono abbastanza ignorante in materia, ho questi atmega da un paio di giorni... perciò vi chiedo conferma per tutto quello che scriverò.
Da quello che ho capito i fuse sono dei parametri che servono ad impostare certe modalità di funzionamento del microcontrollore.
Si possono settare tramite l'ide modificando il file boards.txt oppure tramite avrdude (mai usato). Che poi se non ho capito male l'ide utilizza a sua volta avrdude per flashare sketch/bootloader.
Guardando il file boards.txt che ho precedente modificato, credo che le righe interessate siano le seguenti:
atmega328bb.bootloader.low_fuses=0xE2
atmega328bb.bootloader.high_fuses=0xDA
atmega328bb.bootloader.extended_fuses=0x05
Mi basta modificare il terzo fuse con il valore 0xFF?