Soll das die Frequenz der Sinuskurve sein oder die Abtastfrequenz? Beides sollte mit dem Due machbar sein, ich sehe keine grundlegenden Probleme. Die DAC arbeiten mit bis zu 1MS/s, was also mehr als ausreichend ist. Das Einlesen der Daten von der SD-Karte neben der Ausgabe zu machen, dürfte hingegen eher trickreich sein, deshalb würde ich die Daten von der Karte in den Speicher einlesen und die Stücke so kurz halten, dass sie in's RAM des Due passen.