Encontraste la solución pero tu problema era que no tenias bootloader, de lo contrario tendria que funcionar normalmente. Aclaro que no se me ocurrió que ese fuera el problema, pero ya lo anoto en mi memoria.
Algunos arduinos clones vienen sin el bootloader (mal control de calidad) generalmente aquellos que tienen pines para armar.
Luego con una interfaz USB => Serial puedes programar tu Pro MIN de hecho eso es lo que todos usan.