Hola
Revisa que tengas todos los drivers (y librerías) que hacen falta. Creo que en la última re instalación que hice del sistema operativo tenia unos errores muy parecidos. Eran que faltaba el driver del puerto USB para ese tipo de arduino, el nano.
Prueba primero con un programa nimi (que no haga nada) para descarta la instalación del IDE, de la comunicación con el arduino, el tipo de arduino, etc. Cuando eso lo tengas correcto... pasa a trabajar con tu proyecto.
Saludos y suerte.