Io personalmente delle librerie di Arduino posso anche farne a meno, anzi ultimamente sostituisco diverse cose con la manipolazione dei registri per tante cose.
Il problema nasce quando sviluppi codice che vuoi distribuire. Ti spiego: il leOS o la swRTC non avrebbero avuto il seguito che hanno avuto se non fossero state compatibili con l'IDE di Arduino. Un utente inesperto non deve fare altro che prendere la lib ed includerla nel suo progettino.
Se devi stare anche a scrivere un papiro di 10 pagine per fargli capire come impostare un ambiente di sviluppo differente da quello di Arduino per usare un codice, quell'utente semplicemente non lo fa e non usa il software.
Ecco spiegato il punto fondamentale.
Poi che io debba usare o meno la linea di comando poco me ne importa. Se era possibile, tanto meglio. Altrimenti ne faccio anche a meno. Ma il precedente punto รจ essenziale per poter condividere il codice.