Non ho mai usato telepot, ma direi:
1 - finisci il codice con un while(1), quindi il while principale viene eseguito una sola volta
2 - message_loop mi sembra di capire che lanci dei thread, quindi i valori delle variabili che hai nel while principale non le vedresti comunque aggiornate automaticamente nei thread figli che gestiscono le connessioni telegram (le chiamate a handle)
... ma tutto questo è python non arduino, forse non è il forum corretto...