Wenn du in der IDE unter Tools Bootloader installieren wählst, sollte er nach einer Änderung in der Board.txt auch diese Änderungen nutzen. Das ist mir aber zu unübersichtlich, dort rumzuprobieren. Außerdem mußt du die Fuses dann selber als Hex-Wert umrechnen. Da kann man sich schon mal vertun. Aber jeder so, wie er es mag 
Ehe ich von seriell umverkabele, da nutze ich lieber gleich den ISP Header. Und wenn ich den schon nutze, dann kann ich auch gleich mit eXtremeburner alles machen.
Aber jeder so, wie er es mag